警方為應付未確認生命體而開發了G3系統，這套G3系統是根據未確認生命體4號即幪面超人古迦的力量而設計出來，裝著員是一位叫冰川誠的警員，為人真誠但略為粗獷。警方另一部門在荒島上發現了古代文明，並進行解碼。當未確認生命體再次出現，連G3也不是其對手時，神秘的金色幪面超人亞極陀登場，這個幪面超人是一位失憶的青年津上翔一變身，起初因未能控制而襲擊G3。 　　翔一暫住在美杉義彥的家，認識了擁有超能力的風谷真魚，真魚更幫助翔一四出尋找他失去的記憶，並遇上葦原涼。涼在父親的遺物中，發現一本記事薄，當中提及之姓名卻無人知曉，查探父親死因後，竟發現自己是另一個幪面超人－磯烙使。磯烙使是不完整的亞極陀，所以當涼變身磯烙使後會出現後遺証。有次他相當危險，幸得因超古代文明遺傳因子而誕生的青年所救。之後出現的未確認生命體也相繼被翔一，涼以及誠所打敗。 　　後來，涼誤會女朋友是被亞極陀...

主角有马拓也为一个无所事事的高中生，他父亲是历史学家，却在研究时失踪，留下他与继母两人相依为命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹，里面有一个罗盘和三颗水晶珠，以及一封写着「时间是可逆的，历史是不可逆的」云云以及一些关于平行世界概念的信，并交待主角晚上去当地有名的地标剑之岬去见一个人。 　　拓也晚上如约来到剑之岬，发现自己的继母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收到的邮包交出来，并拔出枪来威胁他，千钧一发之际，一道闪电落下劈在了神社的御神石上，拓也就此晕去。等拓也甦醒过来周围已经旁无一人，回家睡了一觉后才发现不对劲。继母和龙藏寺完全不记得昨晚发生的事情，此时他才发现原来父亲寄给他的遗物是可以让人在平行世界自由穿梭的神奇道具，于是他为了找到父亲真正的下落展开了一系列调查。

21世纪，地球回复昔日的和平，但此时宇宙坠下一颗陨石，陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时，时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现，GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。 　　几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔，但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护，但三个巨像已被破坏剩一个，队员·大伍的战机也被击中，且逃生装置失灵。在危急关头，大伍突然化成光，和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活，并与两大怪兽展开了战斗……

2095年10月31日。未观测的战略级魔法，将朝鲜半岛南端的军事都市及舰队消灭了。自从被称作《灼热的万圣节》的那一天开始，世界因新的战略级魔法师登场而震撼。其中拥有「世界最强的魔法部队」STARS的北美利坚合众国（USNA）感觉到日益强烈的危机感，为了揭露未观测的战略级魔法以及使用这一魔法的魔法师的真面目，而积极地在暗中行动。约两个月后的12月24日。就在整座城市因圣诞节的饰品和灯饰而变得热闹非凡之际，达也等人为了给准备前往美国交换留学的雫饯行，而聚集在艾尼布利榭。雫前往美国的期间是三个月。根据雫所说，和她交换来到第一高校的，是和她同龄的女孩子。与此同时，在USNA的STARS基地，一名少女正准备前往第一高校展开潜入调查。她的名字是安洁莉娜·库都·希尔兹。她身为STARS历代最年轻的总队长，是操纵战略级魔法重金属爆散的USNA最强魔法师——。

喜好Cosplayer，黑魔术代理店兼灵异能力者，爱耍花招但却激萌的nico动画系的占卜师，超级眼镜系的自称超能力者灵异系同人漫画家的大姐姐，憧憬着成为某动画角色的御宅族，感觉不好的大叫的夸大妄想者，将科学无法说明的东西全部否定的超高中级科学家，超级奇怪的杂志《ムムー》的记者，然后还有不可或缺的主人公——作为2ch引用系的博主。他们身边小小的违和感的事情逐渐发展成了超出想象的大事件……

沐浴后能致死的剧毒之雨“Blue Cyst”所导致的大灾难“新月之泪”。在那之后经过100多年的时间，人类终于开始走上了克服这一灾难的道路。在荒废世界的村落“Nest”中坚强生活的人们身边，发现了搭载类双对思考型AI的类人“梅加斯”的身影。 　　时间是公元2242年，失去记忆而沉睡的梅加斯，迎来了觉醒的时刻一-

故事发生在一个依靠着音乐才赖以生存的地方都市之中，音羽歌苗（小松未可子 配音）是一位平凡的高中一年级学生，本来出生在显赫世家的千金大小姐，却因为父母的不断挥霍而不得不早于同龄人许多步，开始思考起自己未来的生计问题。一天，歌苗的面前忽然出现了两名可疑的男子，让歌苗没有想到的是，这两个人，是大名鼎鼎的音乐家贝多芬（杉田智和 配音）和莫扎特（梶裕贵 配音）。　　在两人所组成的乐队Classicaloid演奏时，产生了奇妙的力量，让整个城市都陷入了沸腾之中。之后，肖邦（鸟海浩辅 配音）、李斯特（能登麻美子 配音）、舒伯特（前野智昭 配音）和瓦格纳（松冈祯丞 配音）等音乐奇才纷纷现身。